O sistema Yggdrasil é uma espécie de computador que auxilia Kami Sama a controlar nosso mundo. É o que chamam de Terceiro Mundo. Ele protege e liga todos os Mundos. E como todo computador e software pode possuir falhas, estas falhas são chamadas de Bugs. Estes Bugs costumam causar coisas inexplicáveis e sobrenaturais em nosso Mundo.
Urd possui o trabalho de administrar o sistema junto com outras Deusas. Skuld é a responsavel pela eliminação de Bugs do sistema, ela possui alguns instrumentos especiais para detectar(óculos HUD) os portais de entrada de Bugs, um martelinho para eliminá-los e uma panela elétrica para captura-los.
Este Sistema tem várias funções e é o que dá vida às Deusas. Para elas ficarem na Terra, elas têm que usar energia. Elas emprestam energia de toda a natureza. Essa energia natural é o que dá vida aos espíritos da Terra. Mas as Deusas não podem usá-la até que tenha sido convertida pelo Yggdrasil. Sem essa conversão, as Deusas têm que usar fontes alternativas de energia, como: dormir (Belldandy), tomar uns gorós (Urd) e Sorvete (Skuld).